41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0008 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 106 bp  81.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  85.33 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0008  tRNA-Met  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.192947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0041  tRNA-Met  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.458673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  84.38 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  85.94 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  88.37 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0032  tRNA-Met  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>