30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3428 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3428  UspA domain protein  100 
 
 
153 aa  298  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1304  UspA domain protein  78.43 
 
 
155 aa  241  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.708291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1930  UspA domain protein  55.86 
 
 
149 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110845  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  48.99 
 
 
148 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  48.99 
 
 
150 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.67 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.76 
 
 
153 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  34.48 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  27.4 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.91 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.33 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  27.7 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.83 
 
 
155 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.66 
 
 
141 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.57 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.58 
 
 
307 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.98 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.54 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  40.32 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.29 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.48 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  28.08 
 
 
155 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.67 
 
 
305 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.82 
 
 
139 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.26 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  43.48 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  29.37 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>