More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5062 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
387 aa  790    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22019  predicted protein  50.89 
 
 
437 aa  344  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.15 
 
 
387 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.29 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
390 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.76 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.62 
 
 
382 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.76 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.63 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.76 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  41.44 
 
 
389 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  41.44 
 
 
389 aa  301  9e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
387 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.51 
 
 
389 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 
394 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.09 
 
 
390 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.76 
 
 
389 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.47 
 
 
387 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.35 
 
 
382 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.28 
 
 
386 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.71 
 
 
389 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.02 
 
 
389 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.74 
 
 
387 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.74 
 
 
424 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.74 
 
 
387 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.22 
 
 
389 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.51 
 
 
390 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  41.94 
 
 
447 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.71 
 
 
389 aa  295  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.87 
 
 
381 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.85 
 
 
389 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
389 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  41.99 
 
 
393 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.96 
 
 
389 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.46 
 
 
390 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.73 
 
 
390 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  41.4 
 
 
387 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 
387 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
393 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  41.4 
 
 
387 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 
387 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.41 
 
 
381 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.98 
 
 
390 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
387 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.85 
 
 
388 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.69 
 
 
389 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
389 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
389 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.67 
 
 
391 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.16 
 
 
393 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.18 
 
 
389 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.9 
 
 
393 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.9 
 
 
414 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.9 
 
 
393 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
385 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.9 
 
 
393 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 
387 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.13 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.89 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.63 
 
 
393 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.63 
 
 
393 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  40.65 
 
 
407 aa  286  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.63 
 
 
393 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.86 
 
 
385 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.96 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.9 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.9 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.53 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.63 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.69 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.28 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  40.86 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.18 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.8 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.37 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  38.46 
 
 
417 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.36 
 
 
387 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000377  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.37 
 
 
389 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.749145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.01 
 
 
390 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.31 
 
 
390 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  40.91 
 
 
387 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.25 
 
 
387 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 
393 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
389 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.22 
 
 
389 aa  276  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.11 
 
 
393 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.68 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>