33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1265 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  40.15 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  31.88 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  30.71 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  35.56 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  30.71 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  30.71 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  31.16 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  31.16 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  31.16 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  31.16 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  33.63 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  36.61 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  34.91 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  30.5 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  33.58 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  29.77 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  28.44 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
319 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  28.97 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.9 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  30.09 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  31.86 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  31.86 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  28.93 
 
 
135 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  27.64 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  23.65 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>