30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0370 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 744 aa  1490    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  31.98 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1024 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  50 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  40.67 
 
 		 1793 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  45.63 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  41.94 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  45.05 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  47.83 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  54.1 
 
 		 851 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  47.83 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  40.6 
 
 		 2055 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  58.82 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  58.82 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  25.25 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  56.9 
 
 		 648 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  62.22 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  55.56 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  36.59 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  43.52 
 
 		 342 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.4 
 
 		 897 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  27.09 
 
 		 378 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  30 
 
 		 323 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.56 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2337  hypothetical protein  36.49 
 
 		 298 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00785704  normal  0.0148689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  67.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  34.11 
 
 		 396 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0174  hypothetical protein  39.19 
 
 		 186 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  27.01 
 
 		 382 aa  44.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>