More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3208 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  55.51 
 
 		 277 aa  271  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  57.98 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  48.51 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 500 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  31.62 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  31.23 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  31.62 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  33.47 
 
 		 566 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  29.64 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 301 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 306 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 302 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 315 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  31.23 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 		 497 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 310 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 497 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 545 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 308 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.72 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 		 484 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  31.39 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  30.86 
 
 		 302 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 311 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  28.26 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.65 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  29.83 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.1 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  28.82 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  28.82 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  28.88 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  30.49 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>