42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1516 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
115 aa  229  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  56.19 
 
 
117 aa  120  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  50.46 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  54.78 
 
 
114 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  49.14 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  53.98 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  49.07 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  51.55 
 
 
118 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  41.74 
 
 
116 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  40.35 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  40.57 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.12 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  36.52 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  32.46 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  32.98 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  33.33 
 
 
129 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  26.6 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  30.36 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  27.84 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  30.93 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  34.74 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  36.26 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  30.48 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  33.73 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  30.3 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  28.74 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>