45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1408 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
76 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
76 aa  97.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  61.84 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
78 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
104 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
93 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
93 aa  40  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
81 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>