36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1361 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  64.87 
 
 
293 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  58.48 
 
 
340 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  62.14 
 
 
290 aa  308  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  58.16 
 
 
299 aa  285  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  41.99 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  40.5 
 
 
284 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  36.73 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  39.89 
 
 
294 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  33.88 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  37.57 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  33.5 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  36.04 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  32.08 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  32.38 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.47 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  22.75 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  23.15 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  22.75 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  26.18 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.36 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.29 
 
 
299 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.86 
 
 
305 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.49 
 
 
300 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  27.47 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08340  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  28.1 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24.47 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.79 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  25.88 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.61 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.87 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  27.75 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.22 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.88 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>