52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1803 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  36.76 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  41.23 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2093  hypothetical protein  35.2 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  40.4 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  36.7 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  36.7 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  38.38 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  37.63 
 
 
137 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  38.38 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  38.38 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  33.92 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  30.88 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.63 
 
 
622 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  35.81 
 
 
495 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.82 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.98 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  31.29 
 
 
482 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  29.65 
 
 
367 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  29.82 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  32.43 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  33.98 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  38.98 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.26 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.87 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.3 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  32.69 
 
 
624 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  31.3 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  42.37 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  36.21 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  32.76 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  32.76 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  29.92 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  38.78 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  31.46 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.82 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  32.76 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 
483 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  33.06 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.4 
 
 
363 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  32.23 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>