162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2199 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.67 
 
 		 183 aa  244  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  56.73 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  53.22 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  47.43 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  43.68 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.03 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0665  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  45.35 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  43.71 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1837  glycine cleavage system transcriptional repressor  37.93 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.412104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1898  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1662  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  37.93 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4388  hypothetical protein  37.57 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51280  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1236  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.78 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4182  glycine cleavage system transcriptional repressor  36.78 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1266  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  36.78 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.747511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3976  glycine cleavage system transcriptional repressor  36.21 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1370  glycine cleavage system transcriptional repressor  36.63 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35350  Transcriptional repressor glycine cleavage system-like protein  37.42 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3954  hypothetical protein  34.48 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1547  glycine cleavage system transcriptional repressor  34.48 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.54 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  31.74 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.54 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.54 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.98 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.56 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0639  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.86 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.33 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  32.72 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  34.57 
 
 		 180 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.23 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.72 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  31.21 
 
 		 180 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.23 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.83 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.86 
 
 		 228 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.46 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  29.59 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  28.99 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 212 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 212 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.93 
 
 		 212 aa  97.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.99 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  30.54 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  28.99 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  28.99 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.99 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.48 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.99 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  28.99 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.99 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.81 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.91 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  29.48 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.99 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.65 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  31.58 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  30.18 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  35.57 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2479  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.204447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  27.59 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.01 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.92 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  28.49 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  28.99 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  26.82 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  27.91 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  26.32 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  27.53 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  30.43 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  30.43 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.48 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  29.21 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  29.88 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.6 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  27.06 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  28.48 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.22 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.18 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  27.06 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  32.26 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  27.65 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  32.64 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.79 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>