86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1510 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1898  transcriptional regulator  88.17 
 
 		 208 aa  352  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1837  glycine cleavage system transcriptional repressor  88.17 
 
 		 191 aa  352  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.412104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  94.97 
 
 		 159 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  39.56 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  46.45 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.81 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.71 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.38 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  39.66 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1266  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  35.39 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.747511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1236  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.39 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4182  glycine cleavage system transcriptional repressor  35.39 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3976  glycine cleavage system transcriptional repressor  34.83 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4388  hypothetical protein  35.23 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51280  hypothetical protein  35.23 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3954  hypothetical protein  33.15 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1662  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  35.48 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1547  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.15 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1370  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.15 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0665  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.53 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35350  Transcriptional repressor glycine cleavage system-like protein  35.48 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  30.34 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0639  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.91 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  28.99 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.09 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  28.57 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  25.58 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.84 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.84 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.81 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.38 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.63 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.22 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.63 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.7 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  24.14 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.43 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.54 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.54 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.86 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.54 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.54 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.7 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.26 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.54 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  22.54 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.54 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.54 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  21.08 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.7 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.95 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  26.8 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2479  glycine cleavage system transcriptional repressor  22.81 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.204447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.86 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  30.72 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.79 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.68 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  23.49 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  21.64 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  19.54 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.45 
 
 		 166 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  21.37 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.32 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  19.08 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  18.97 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  25 
 
 		 166 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  22.78 
 
 		 220 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  25 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>