76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1898 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1898  transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  430  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1837  glycine cleavage system transcriptional repressor  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.412104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  88.17 
 
 		 186 aa  352  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  90.57 
 
 		 159 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  46.45 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  37.78 
 
 		 184 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.62 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.93 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.38 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  39.55 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4388  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4182  glycine cleavage system transcriptional repressor  34.27 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1266  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  34.27 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.747511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1236  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  34.27 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3954  hypothetical protein  32.6 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3976  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.71 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1547  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.04 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1662  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  34.44 
 
 		 185 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1370  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.58 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0665  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  37.5 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35350  Transcriptional repressor glycine cleavage system-like protein  34.84 
 
 		 165 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0639  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.68 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  28.99 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  29.56 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.27 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.27 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.22 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.93 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.22 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.81 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  27.81 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  27.33 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.46 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.46 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.46 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.79 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  26.7 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.97 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.63 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.16 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  20.81 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.43 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.39 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  22.99 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.43 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  22 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.43 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  27.03 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.59 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2479  glycine cleavage system transcriptional repressor  22.22 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.57 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  27.71 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  24.11 
 
 		 385 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  19.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  18.34 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>