79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1390 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  68.16 
 
 
204 aa  293  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  59.9 
 
 
203 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  60.89 
 
 
202 aa  257  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  62.19 
 
 
204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  58.71 
 
 
201 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  56.72 
 
 
205 aa  248  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  57 
 
 
204 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  56.93 
 
 
205 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  56.22 
 
 
205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  56.44 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  56.22 
 
 
237 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  56.22 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  58.33 
 
 
205 aa  237  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  56.22 
 
 
201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  58 
 
 
204 aa  225  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  57.89 
 
 
205 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  52.91 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  48 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  35.03 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  45.16 
 
 
177 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  32.61 
 
 
405 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  27.13 
 
 
410 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  25.97 
 
 
400 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  25.41 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  29.5 
 
 
410 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  27.87 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  28.12 
 
 
405 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  28.12 
 
 
405 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  29.14 
 
 
405 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  29.35 
 
 
279 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  30.71 
 
 
418 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  31.15 
 
 
404 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  29.57 
 
 
281 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  29.59 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  34.33 
 
 
298 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  23.96 
 
 
413 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  30 
 
 
418 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  30.71 
 
 
429 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
454 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  25.59 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
281 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 
404 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  31.2 
 
 
429 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  28.73 
 
 
411 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  29.89 
 
 
568 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  27.03 
 
 
279 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  31.29 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  32 
 
 
415 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  32 
 
 
404 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
281 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0333  phosphoserine phosphatase SerB  25.9 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  31.2 
 
 
404 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  27.42 
 
 
281 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  28.48 
 
 
406 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  31.2 
 
 
404 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  30.05 
 
 
281 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  29.08 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  26.6 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  26.49 
 
 
410 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  28.1 
 
 
412 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  30.72 
 
 
406 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  31.01 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
408 aa  42  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  26.67 
 
 
206 aa  42  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  27.87 
 
 
285 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  26.78 
 
 
285 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  21.11 
 
 
435 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  24.87 
 
 
411 aa  41.2  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>