171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1119 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  55.63 
 
 
313 aa  285  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  42.9 
 
 
330 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  44.33 
 
 
326 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  38.08 
 
 
321 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  41.53 
 
 
325 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  37.93 
 
 
316 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  38.26 
 
 
336 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  37.26 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  36.89 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.09 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  36.45 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  36.57 
 
 
321 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  36.57 
 
 
321 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  36.68 
 
 
323 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  37.22 
 
 
326 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  36.68 
 
 
323 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  36.68 
 
 
323 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.06 
 
 
638 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  33.97 
 
 
317 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  36.57 
 
 
321 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  36.91 
 
 
322 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  36.42 
 
 
321 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
638 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  33.03 
 
 
341 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  32.81 
 
 
339 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  38.24 
 
 
324 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  39.32 
 
 
343 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
639 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  38.19 
 
 
321 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  43.35 
 
 
339 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  40.67 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  35.41 
 
 
318 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  35.15 
 
 
322 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  35.55 
 
 
320 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  36.01 
 
 
329 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  41.57 
 
 
335 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  31.15 
 
 
330 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  36.27 
 
 
319 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  33.23 
 
 
320 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2672  glucokinase  40.07 
 
 
326 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  32.81 
 
 
321 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  36.12 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  33.97 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.51 
 
 
334 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
641 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  34.45 
 
 
319 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  34.11 
 
 
319 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  34.11 
 
 
319 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
641 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
641 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
641 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3372  Glucokinase  44.76 
 
 
318 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  32.56 
 
 
324 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  40.41 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  35.87 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  35.62 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
620 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
620 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
620 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
641 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  33.78 
 
 
320 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  34.56 
 
 
315 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  33.67 
 
 
335 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  33.67 
 
 
335 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  33.54 
 
 
326 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
616 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  38.39 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  37.82 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  37.08 
 
 
337 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  38.87 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  37.5 
 
 
317 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  35.85 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
642 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  34.09 
 
 
327 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  34.82 
 
 
351 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  34.82 
 
 
351 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
642 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  31.71 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  35.28 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  33.77 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  38.43 
 
 
351 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  33.65 
 
 
332 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
642 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  32.59 
 
 
320 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>