More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1073 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  59.21 
 
 
328 aa  358  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.27 
 
 
333 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.92 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1723  quinone oxidoreductase  49.69 
 
 
334 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  49.69 
 
 
334 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.71 
 
 
326 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.02 
 
 
330 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.3 
 
 
335 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
588 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  50 
 
 
326 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
326 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.24 
 
 
331 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.4 
 
 
331 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.96 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.69 
 
 
326 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
326 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  50 
 
 
326 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.5 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.39 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  50.99 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.65 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  48.33 
 
 
324 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.33 
 
 
324 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  48.33 
 
 
324 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  48.02 
 
 
324 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  48.02 
 
 
324 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.97 
 
 
327 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.24 
 
 
332 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  48.47 
 
 
326 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  48.33 
 
 
324 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  48.02 
 
 
324 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  48.33 
 
 
324 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
326 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  47.72 
 
 
324 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  49.24 
 
 
332 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  48.77 
 
 
326 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.66 
 
 
335 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 
331 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  50.64 
 
 
324 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  50.64 
 
 
324 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  50.64 
 
 
324 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  50.32 
 
 
324 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.17 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.88 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  50.64 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3837  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.56 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.51 
 
 
325 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  48.08 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  48.08 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.72 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.44 
 
 
325 aa  271  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  47.58 
 
 
326 aa  271  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
324 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.16 
 
 
325 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
330 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  47.76 
 
 
325 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  46.04 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  45.43 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.09 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.04 
 
 
334 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  47.73 
 
 
328 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 
328 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.12 
 
 
332 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
332 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.12 
 
 
332 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
326 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.47 
 
 
327 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.82 
 
 
328 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
326 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  45.85 
 
 
327 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.12 
 
 
332 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.54 
 
 
327 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
328 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
326 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.79 
 
 
329 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.68 
 
 
327 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.62 
 
 
332 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.84 
 
 
327 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.46 
 
 
327 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.06 
 
 
327 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
345 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.92 
 
 
327 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  45.73 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  47.31 
 
 
330 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.6 
 
 
332 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.18 
 
 
338 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
342 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.51 
 
 
327 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  47.33 
 
 
327 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.09 
 
 
332 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
328 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>