66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4830 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  929    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  55.51 
 
 
465 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  56.14 
 
 
462 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  53.98 
 
 
465 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  43.57 
 
 
475 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  38.34 
 
 
474 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  25.93 
 
 
444 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  23.91 
 
 
457 aa  103  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  23.34 
 
 
453 aa  94  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  22.6 
 
 
454 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  26.99 
 
 
446 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  25.93 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  33.17 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  26.21 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  25.65 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  29.12 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  25.17 
 
 
557 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  26.49 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3586  hypothetical protein  24.16 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000666104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  27.74 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  26.09 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  28.9 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  23.39 
 
 
539 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  25.58 
 
 
463 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  22.35 
 
 
464 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  24.15 
 
 
583 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  23.56 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  23.44 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  23.31 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  23.31 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  23.31 
 
 
471 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  23.19 
 
 
865 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  23.6 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  28.57 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  22.22 
 
 
477 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  23.04 
 
 
476 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  27.63 
 
 
451 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  21.64 
 
 
490 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  23.15 
 
 
456 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  20.63 
 
 
481 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  21.58 
 
 
471 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1086  hypothetical protein  21.71 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  27.13 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  22.88 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  22.76 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  21.39 
 
 
471 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  21.39 
 
 
478 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  21.39 
 
 
478 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  21.39 
 
 
478 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  22.16 
 
 
520 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  21.39 
 
 
471 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  21.39 
 
 
471 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  21.98 
 
 
488 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  23.63 
 
 
476 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  21.39 
 
 
477 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  21.39 
 
 
477 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  22.14 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  25.93 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  21.1 
 
 
861 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  21.87 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  23.91 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  23.68 
 
 
472 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  21.51 
 
 
481 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  23.08 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  20.18 
 
 
482 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  20.59 
 
 
482 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>