32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3607 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 99 aa  191  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  42.16 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  42.42 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  44.09 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  39.18 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  42.22 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  40.43 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  40.43 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  43.28 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  29.59 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  38.61 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  35.29 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  32.63 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  29.67 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  42.39 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  32.99 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  32.97 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  39.58 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  39.58 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  26.21 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>