29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1849 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  100 
 
 
349 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  58.58 
 
 
344 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.21 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  38.11 
 
 
388 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  36.29 
 
 
392 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  35.25 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  40.2 
 
 
833 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  31.33 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  27.61 
 
 
384 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  37.18 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  34.82 
 
 
468 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  35.21 
 
 
358 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  38.69 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  29.97 
 
 
489 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  36.14 
 
 
428 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  37.88 
 
 
260 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  39.25 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  38.51 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  36.45 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  35.93 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  30.28 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  26.76 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  29.06 
 
 
468 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  24.81 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  36.03 
 
 
403 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  35.04 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  27.15 
 
 
2169 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  30.56 
 
 
326 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  30.99 
 
 
475 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>