25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0933 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  63.64 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  37.72 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  35.09 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  32.43 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  31.03 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  30.59 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  27.18 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  31.53 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  27.12 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  33.7 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  28.42 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  32.99 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  32.99 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 120 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  32.94 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  32.94 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  27.62 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>