52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0040 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.552178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0194635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08330  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0848374 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.152542 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.488566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04940  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.669042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1191  tRNA-Ala  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0467574  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0019  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122889  normal  0.598483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>