223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0027 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0031  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.488566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0022  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0049  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0044  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.521013  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  88.06 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  89.66 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0040  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0037  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386213  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0023  tRNA-Ala  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592453  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0035  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0022  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  86.57 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0001  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0035  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  87.93 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  87.93 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0072  tRNA-Ala  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665456  hitchhiker  0.000486615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0019  tRNA-Ala  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122889  normal  0.598483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0039  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.980011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  84.21 
 
 
78 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0011  tRNA-Ala  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0064  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0017  tRNA-Ala  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0017  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0016  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650839  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>