More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0614 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0614  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
463 aa  915    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.242087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.58 
 
 
304 aa  299  8e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 
469 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 
469 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 
444 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.51 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 
312 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.01 
 
 
340 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  43.04 
 
 
350 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.16 
 
 
331 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.13 
 
 
342 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.21 
 
 
309 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.31 
 
 
381 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 
351 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.99 
 
 
416 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.99 
 
 
416 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  43.56 
 
 
408 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.69 
 
 
362 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.56 
 
 
320 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.22 
 
 
409 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.81 
 
 
452 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.9 
 
 
409 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.31 
 
 
453 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.12 
 
 
405 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.83 
 
 
432 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  44.66 
 
 
495 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  44.66 
 
 
471 aa  259  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 
319 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
373 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.25 
 
 
328 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  43.89 
 
 
317 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.08 
 
 
329 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.81 
 
 
329 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05700  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.65 
 
 
384 aa  256  5e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00177704  normal  0.0500251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
320 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.69 
 
 
514 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.71 
 
 
346 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  43.26 
 
 
311 aa  255  9e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.03 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.24 
 
 
326 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.69 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.46 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  44.48 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.97 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  41.64 
 
 
541 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.69 
 
 
497 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.13 
 
 
320 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.04 
 
 
320 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.56 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.69 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.41 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 
329 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  45.95 
 
 
472 aa  253  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 
329 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.72 
 
 
483 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  43.46 
 
 
305 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0455  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 
382 aa  252  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000410251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 
301 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.75 
 
 
497 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  45.52 
 
 
499 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.65 
 
 
376 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.78 
 
 
447 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.21 
 
 
295 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  43.75 
 
 
498 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  43.75 
 
 
498 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  45.95 
 
 
491 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  45.95 
 
 
491 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  43.75 
 
 
498 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  45.95 
 
 
491 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 
320 aa  251  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  44.05 
 
 
497 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  43.75 
 
 
498 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.31 
 
 
387 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  43.75 
 
 
498 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  44.05 
 
 
497 aa  250  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  43.75 
 
 
512 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1399  signal recognition particle receptor (docking protein)  44.23 
 
 
463 aa  250  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.6 
 
 
304 aa  250  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  45.95 
 
 
491 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.64 
 
 
410 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.97 
 
 
381 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  43.69 
 
 
324 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  44.29 
 
 
393 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  45.63 
 
 
491 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.29 
 
 
379 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.75 
 
 
317 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.51 
 
 
329 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.04 
 
 
506 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.53 
 
 
386 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  45.31 
 
 
511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.34 
 
 
643 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.58 
 
 
524 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.34 
 
 
491 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>