36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0638 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  35.44 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.59 
 
 		 254 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.8 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  30 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  25.89 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  25 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  26.91 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  32.41 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  34.33 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  20.87 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  23.58 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  24.74 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  21.67 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  23.9 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0302  hypothetical protein  48.72 
 
 		 47 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  24.3 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  20.93 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1891  PT repeat-containing protein  51.11 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.980004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>