More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0251 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  69.11 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  69.11 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  67.48 
 
 		 249 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  68.72 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  69.55 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.563363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  69.14 
 
 		 242 aa  348  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  68.85 
 
 		 259 aa  348  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  68.85 
 
 		 259 aa  348  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  68.31 
 
 		 242 aa  348  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  66.67 
 
 		 249 aa  341  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  61.79 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  62.2 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  62.55 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  62.55 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  45.06 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  47.58 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  45.75 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  49.38 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  44.35 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  46.56 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  42.91 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  47.52 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  42.15 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  42.15 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.89 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  46.12 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  41.76 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  41.76 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.5 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  45.04 
 
 		 243 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  45.9 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  44.84 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  44.84 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  49.11 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  43.78 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.12 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  44.35 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  47.11 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  41.76 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  44.62 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.08 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.08 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  41.76 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.08 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.08 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  46.53 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  47.35 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  45.87 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  44.84 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  46.5 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>