More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0900 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  100 
 
 
383 aa  797    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  66.41 
 
 
381 aa  487  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  46.21 
 
 
372 aa  338  7e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  44.99 
 
 
375 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  44.65 
 
 
374 aa  328  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
375 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  41.19 
 
 
374 aa  309  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  44.13 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  41.32 
 
 
379 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  44.79 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  42.3 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
381 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
377 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  44.69 
 
 
380 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
375 aa  292  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  43.16 
 
 
379 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.23 
 
 
376 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 
381 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  43.6 
 
 
384 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  43.6 
 
 
384 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  41.45 
 
 
375 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  43.34 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  43.67 
 
 
389 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  40.84 
 
 
376 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  41.82 
 
 
385 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  40.94 
 
 
377 aa  275  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.25 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  42.23 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  44.76 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 
376 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  42.93 
 
 
384 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  39.84 
 
 
380 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
375 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  38.48 
 
 
374 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  39.38 
 
 
379 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  37.18 
 
 
386 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  40 
 
 
382 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
376 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
376 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  38.54 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  39.64 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  39.64 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  39.64 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  39.64 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.31 
 
 
377 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
376 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
376 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  36.89 
 
 
374 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  43.33 
 
 
387 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  39.43 
 
 
380 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  39.28 
 
 
379 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
374 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  37.06 
 
 
388 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  35.58 
 
 
375 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
377 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  39.23 
 
 
380 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  36.95 
 
 
381 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  37.05 
 
 
370 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  37.73 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  35.58 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  37.63 
 
 
378 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 
386 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  37.66 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
380 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
376 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  37.7 
 
 
380 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  37.14 
 
 
389 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  38.28 
 
 
374 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  36.2 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  37.56 
 
 
385 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  37.24 
 
 
379 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  36.52 
 
 
388 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  37.63 
 
 
379 aa  239  8e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  37.37 
 
 
381 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  35.7 
 
 
388 aa  239  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 
376 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  36.53 
 
 
370 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  35.16 
 
 
376 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
375 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  36.81 
 
 
375 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  34.9 
 
 
376 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
378 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  34.9 
 
 
376 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  36.98 
 
 
379 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  34.9 
 
 
376 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  34.9 
 
 
376 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  34.9 
 
 
376 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40 
 
 
377 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>