More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3095 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  39.16 
 
 
1911 aa  1043    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  45.19 
 
 
1440 aa  1002    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  39.89 
 
 
4212 aa  888    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  46.03 
 
 
4580 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  40.69 
 
 
2393 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  35.73 
 
 
3231 aa  1241    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  43.12 
 
 
4874 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.38 
 
 
2284 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  34.2 
 
 
4539 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  46.03 
 
 
4101 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  43.29 
 
 
5021 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  35.77 
 
 
1696 aa  1023    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  45.95 
 
 
4649 aa  767    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  58.41 
 
 
5566 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.78 
 
 
3925 aa  1398    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  44.85 
 
 
5628 aa  851    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  34.32 
 
 
4555 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  45.62 
 
 
4157 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  58.62 
 
 
1315 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  41.38 
 
 
5993 aa  1332    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  59.94 
 
 
4869 aa  2313    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.11 
 
 
2363 aa  894    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  47.38 
 
 
3525 aa  912    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  43.8 
 
 
4036 aa  2013    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  42.55 
 
 
4588 aa  1098    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  43.1 
 
 
5612 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  35.61 
 
 
4429 aa  1071    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  60.99 
 
 
2726 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  39.4 
 
 
5854 aa  2889    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  52.93 
 
 
1262 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  34.34 
 
 
7149 aa  1065    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  38.84 
 
 
1717 aa  1117    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  45.29 
 
 
1601 aa  1220    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  44.61 
 
 
2725 aa  852    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  42.93 
 
 
3818 aa  867    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  40.37 
 
 
5822 aa  1400    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  60.99 
 
 
2653 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  40.57 
 
 
5778 aa  1403    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  46.03 
 
 
4098 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  40.67 
 
 
2727 aa  1564    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  45.89 
 
 
4122 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  34.32 
 
 
4614 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  39.99 
 
 
5915 aa  1384    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  43.03 
 
 
5023 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  44.39 
 
 
5802 aa  1721    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
7157 aa  14780    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  38.38 
 
 
6876 aa  1556    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  45.76 
 
 
4123 aa  637  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  42.24 
 
 
2260 aa  631  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  42.8 
 
 
2501 aa  631  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  44.36 
 
 
4048 aa  632  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1667  polyketide synthase, putative  34.67 
 
 
1901 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  38.05 
 
 
3811 aa  548  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 
4478 aa  547  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  39.92 
 
 
1749 aa  533  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  29.7 
 
 
3645 aa  535  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  45.81 
 
 
2463 aa  532  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  27.25 
 
 
3781 aa  520  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  27.35 
 
 
3780 aa  520  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
2551 aa  518  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  29.09 
 
 
1272 aa  514  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  41.35 
 
 
1619 aa  508  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.03 
 
 
3695 aa  508  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  47.05 
 
 
2551 aa  506  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 
3176 aa  509  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 
3696 aa  503  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  29.85 
 
 
4080 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2376  Beta-ketoacyl synthase  29.73 
 
 
1620 aa  501  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 
3099 aa  499  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.37 
 
 
7210 aa  491  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  29.04 
 
 
3711 aa  488  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  35.89 
 
 
2063 aa  487  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 
1656 aa  486  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  28.86 
 
 
3494 aa  480  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  32.06 
 
 
2880 aa  481  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.07 
 
 
3930 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 
3679 aa  474  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 
3676 aa  474  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  45.24 
 
 
591 aa  471  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
3702 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  33.51 
 
 
2006 aa  470  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  29.64 
 
 
5255 aa  468  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
3693 aa  467  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
3693 aa  467  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 
5400 aa  468  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  30.27 
 
 
2508 aa  464  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  28.94 
 
 
4882 aa  464  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
7110 aa  464  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 
1613 aa  461  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  40.75 
 
 
2103 aa  461  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  28.53 
 
 
3463 aa  456  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  28.28 
 
 
7279 aa  455  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  32.65 
 
 
4151 aa  454  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 
2762 aa  449  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  32.28 
 
 
3427 aa  444  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 
2975 aa  440  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0171  polyketide synthase  38.37 
 
 
1798 aa  442  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0449  DszB  38.37 
 
 
1778 aa  442  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 
3130 aa  442  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.73 
 
 
1087 aa  437  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>