More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5289 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
3525 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  34.34 
 
 
4212 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  36.99 
 
 
1440 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  32.67 
 
 
6876 aa  708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 
2725 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  100 
 
 
1911 aa  3961    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  35.17 
 
 
5993 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  41.3 
 
 
4036 aa  770    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 
1601 aa  775    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  39.16 
 
 
7157 aa  1037    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 
5802 aa  954    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  33.64 
 
 
5822 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  33.68 
 
 
5778 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  33.16 
 
 
5915 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  36.81 
 
 
2727 aa  881    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 
5854 aa  897    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 
3231 aa  636  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  43.92 
 
 
4588 aa  623  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 
4869 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  46.19 
 
 
2463 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  26.88 
 
 
5612 aa  546  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  41.15 
 
 
4429 aa  536  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  41.66 
 
 
5628 aa  533  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  35.01 
 
 
7149 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 
2393 aa  513  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  43.74 
 
 
1315 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.3 
 
 
3925 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  42.84 
 
 
4649 aa  486  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  39.37 
 
 
4555 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  38.54 
 
 
4580 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  38.54 
 
 
4101 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  38.54 
 
 
4098 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  38.54 
 
 
4122 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  35.25 
 
 
4048 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  38.33 
 
 
4157 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  38.02 
 
 
4123 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  38.91 
 
 
4539 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  42.52 
 
 
5566 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  45.38 
 
 
2653 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  45.38 
 
 
2726 aa  454  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
2551 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  31.77 
 
 
1696 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  45.38 
 
 
4614 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  35.83 
 
 
2260 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  34.63 
 
 
2501 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  34.38 
 
 
2284 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  43.4 
 
 
591 aa  436  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.27 
 
 
4478 aa  433  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 
3702 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.66 
 
 
3693 aa  430  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  38.8 
 
 
1262 aa  430  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.66 
 
 
3693 aa  430  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
3676 aa  426  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 
3176 aa  420  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  39 
 
 
1749 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  34.45 
 
 
3811 aa  417  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.26 
 
 
3099 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 
3679 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  37.41 
 
 
1619 aa  413  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.05 
 
 
3696 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  32.93 
 
 
4874 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  33 
 
 
5021 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
2880 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  32.93 
 
 
3818 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  32.92 
 
 
5023 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.64 
 
 
2363 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  28.3 
 
 
4080 aa  396  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.71 
 
 
1656 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.37 
 
 
3427 aa  397  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.37 
 
 
3930 aa  397  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  37.99 
 
 
1717 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  39.29 
 
 
2082 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  35.83 
 
 
1272 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
7279 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
3645 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
5400 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  30.32 
 
 
3781 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  31.74 
 
 
3463 aa  384  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  33.73 
 
 
4354 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  30.42 
 
 
3780 aa  380  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  35.84 
 
 
1613 aa  380  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  36.19 
 
 
2006 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  30.15 
 
 
3711 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.1 
 
 
7210 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.03 
 
 
2551 aa  374  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  28.4 
 
 
3148 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  28.07 
 
 
4882 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2385  Beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 
1298 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0539638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  34.74 
 
 
3739 aa  370  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
7110 aa  370  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 
3130 aa  370  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 
3695 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
3092 aa  366  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 
4646 aa  365  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.5 
 
 
1372 aa  365  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  31.3 
 
 
2201 aa  363  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 
2333 aa  363  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
2508 aa  362  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
2462 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  27.86 
 
 
3045 aa  358  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>