More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2728 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2287  histidine kinase  56.36 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000635078  normal  0.170007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  51.44 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  48.9 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  43.91 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  41.91 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  38.31 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  41.76 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  40.49 
 
 		 391 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  39.14 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  38.48 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  37.66 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2934  histidine kinase  36.43 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  33.33 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  34.91 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  34.34 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  34.79 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 589 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  28.17 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  28 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  28 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  28 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.38 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  26.64 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  26.23 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  26.1 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  23.92 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  25.21 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 827 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  26.69 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  25.82 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  25.82 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  32.31 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  37.04 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 969 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 640 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1022 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2127  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  29.24 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 576 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.78 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.48 
 
 		 1041 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2278  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.530752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 997 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  32.07 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  27.87 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  23.53 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29.28 
 
 		 1298 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  26.75 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 991 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2145  histidine kinase  26.78 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2677  histidine kinase  25.58 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000481143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 926 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  29.82 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  35.45 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  25.77 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.9 
 
 		 778 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.31 
 
 		 778 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.9 
 
 		 778 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  25.77 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0315  putative sensor histidine kinase  30.86 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>