26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4172 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 237 aa  447  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  50.24 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.68 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.37 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.75 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  35.22 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  31.03 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.72 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.03 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.95 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.67 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.5 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.17 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  38.97 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  30.58 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.49 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.86 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.5 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.65 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.95 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  36.46 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  30.14 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>