32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3853 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
219 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
292 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
260 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.18 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  33.16 
 
 
303 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
286 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  35.68 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.28 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.51 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 
271 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
324 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  47.46 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
402 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.64 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
331 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  24.79 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3841  hypothetical protein  40.91 
 
 
278 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  25.96 
 
 
256 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
251 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>