29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3425 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  34.92 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  36.45 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  35.5 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  33.02 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2922  hypothetical protein  31.56 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  32.84 
 
 		 479 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  50 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  26.41 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  25.36 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  36.03 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  28.4 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.34 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  25.64 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  32 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  43.18 
 
 		 434 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30.71 
 
 		 456 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  45.45 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  45.45 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  45.45 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06187  Flp pilus assembly protein TadG  34.58 
 
 		 515 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  45.45 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  26.28 
 
 		 605 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  45.83 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  24.16 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  25.48 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  31.31 
 
 		 409 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 666 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>