More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2212 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2212  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
600 aa  1162    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0414  glycosyl transferase family protein  47.36 
 
 
633 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.89 
 
 
367 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.54 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  41.76 
 
 
1739 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.41 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.39 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  43.97 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
318 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
247 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
983 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.57 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
321 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
357 aa  67  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.13 
 
 
311 aa  67  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
276 aa  67  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
336 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
373 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.45 
 
 
327 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
250 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  39 
 
 
324 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
329 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
330 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
329 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
280 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
347 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
337 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
300 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
327 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
1250 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
365 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
727 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
369 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.24 
 
 
134 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
333 aa  65.1  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  35.42 
 
 
341 aa  64.7  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
316 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
377 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
249 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
376 aa  64.3  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
302 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
1177 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
1177 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
290 aa  63.9  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
341 aa  63.9  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
318 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
332 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 
347 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
347 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
337 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
1035 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
338 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
338 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  34.81 
 
 
329 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
374 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
217 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
350 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
333 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
317 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.96 
 
 
729 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
351 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.73 
 
 
325 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
309 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  33.96 
 
 
392 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
146 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
345 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 
361 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
347 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
301 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
249 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
704 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2791  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
277 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
316 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  31.01 
 
 
386 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
482 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  21.01 
 
 
355 aa  62  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.55 
 
 
275 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
373 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>