49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0976 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0976  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  100 
 
 		 220 aa  414  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  40.93 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2345  flagellar assembly protein FliH  36.32 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1652  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  40.74 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257969  normal  0.368301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  32.61 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  30.27 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.73 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  30.27 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.2 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  31.34 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.61 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.05 
 
 		 296 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.1 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.52 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  29.82 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  29.1 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  32.4 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  31.02 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  33.93 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 268 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  31.11 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  29.24 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.03 
 
 		 338 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.03 
 
 		 338 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.88 
 
 		 307 aa  45.4  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.03 
 
 		 338 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  24.02 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  24.28 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  28.23 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  24.08 
 
 		 339 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  31.49 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>