32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_A3570 on replicon NC_007515
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  100 
 
 		 74 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  70.83 
 
 		 74 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  64.38 
 
 		 74 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  61.97 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  63.01 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  52.7 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  54.05 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.35 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  54.69 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.89 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  46.48 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  46.48 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  43.66 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.66 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  39.19 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  51.02 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  41.89 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.48 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  36.62 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  36.62 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0470  CopG domain protein DNA-binding domain protein  32.39 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000198456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  37.68 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1238  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.937532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0627  CopG domain protein DNA-binding domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1271  CopG domain protein DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  54.05 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4248  transcriptional regulator, CopG family  46.15 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0175241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  43.24 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  43.24 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1107  ribbon-helix-helix protein, copG family  37.29 
 
 		 73 aa  40  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>