More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2658 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2758  PDZ/DHR/GLGF domain protein  71.32 
 
 
1010 aa  1439    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  100 
 
 
1003 aa  2045    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  30.92 
 
 
870 aa  102  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  21.73 
 
 
1585 aa  84.7  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  33.33 
 
 
296 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  30.77 
 
 
1156 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  27.13 
 
 
762 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  32.65 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  34.05 
 
 
426 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  31.09 
 
 
479 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.22 
 
 
731 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  28.57 
 
 
855 aa  68.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  24.71 
 
 
715 aa  67.8  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  29.72 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  29.71 
 
 
450 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  27.78 
 
 
305 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.46 
 
 
427 aa  66.6  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  26.69 
 
 
542 aa  66.2  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  31.94 
 
 
1061 aa  66.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  23.42 
 
 
2413 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  28.41 
 
 
821 aa  64.7  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  26.78 
 
 
404 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  28.63 
 
 
321 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  29.41 
 
 
931 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
1021 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  24.72 
 
 
541 aa  62.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  38.6 
 
 
173 aa  62.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
1030 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  29.75 
 
 
431 aa  62.4  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  28.99 
 
 
640 aa  62.4  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  33.33 
 
 
144 aa  62  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  29.36 
 
 
790 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.78 
 
 
483 aa  61.2  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  22.26 
 
 
954 aa  60.8  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  28.18 
 
 
226 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  26.14 
 
 
287 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  32.48 
 
 
1249 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  29 
 
 
278 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  29.58 
 
 
247 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  27.04 
 
 
891 aa  59.7  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  23.63 
 
 
335 aa  60.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  27.37 
 
 
865 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  25.5 
 
 
723 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  28.18 
 
 
196 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  31.44 
 
 
750 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
1622 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.85 
 
 
2171 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  21.28 
 
 
545 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  25.95 
 
 
494 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  29.78 
 
 
266 aa  58.9  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.22 
 
 
1402 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  25.91 
 
 
236 aa  58.5  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  28.24 
 
 
138 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  23.75 
 
 
1005 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  27.62 
 
 
226 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  27.62 
 
 
196 aa  57.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  24.17 
 
 
483 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  27.59 
 
 
337 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  30.81 
 
 
196 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  27.62 
 
 
196 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0099  Ankyrin  26.77 
 
 
230 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5207100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  29.19 
 
 
578 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  31.63 
 
 
490 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  27.62 
 
 
196 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  27.27 
 
 
395 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3768  ankyrin  27.9 
 
 
525 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  28.25 
 
 
423 aa  56.2  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 
398 aa  56.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  37.5 
 
 
318 aa  55.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  27.53 
 
 
196 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2699  Ankyrin  30.12 
 
 
360 aa  55.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  29.61 
 
 
261 aa  55.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  31.61 
 
 
590 aa  54.7  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  27.18 
 
 
472 aa  54.7  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  31.03 
 
 
194 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2700  hypothetical protein  32 
 
 
360 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.57882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  31.69 
 
 
297 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  46.43 
 
 
135 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  38.64 
 
 
139 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  28.83 
 
 
4520 aa  53.9  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  28.8 
 
 
933 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  29.58 
 
 
288 aa  53.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  31.93 
 
 
329 aa  53.5  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  28.31 
 
 
257 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  27.53 
 
 
544 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  35.71 
 
 
398 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  40.35 
 
 
387 aa  53.5  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  31.58 
 
 
170 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  36.76 
 
 
462 aa  53.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.33 
 
 
482 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  40.35 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  29.49 
 
 
472 aa  53.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  40.35 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  40.35 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2266  hypothetical protein  29.94 
 
 
445 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  40.35 
 
 
388 aa  53.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
388 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  40.35 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  29.66 
 
 
460 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2080  Ankyrin  28.57 
 
 
668 aa  53.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000184702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>