More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2683 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2683  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.857311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1890  hypothetical protein  35.51 
 
 
328 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0206796  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0685  hypothetical protein  34.22 
 
 
336 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3777  hypothetical protein  33.89 
 
 
331 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2120  hypothetical protein  32.85 
 
 
326 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0805  hypothetical protein  33.45 
 
 
334 aa  175  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3062  hypothetical protein  31.56 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0982  hypothetical protein  32.28 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.03 
 
 
347 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3386  hypothetical protein  29.79 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  28.2 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0465  NMT1/THI5 like domain protein  29.32 
 
 
327 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0409028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2822  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 
331 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  26.28 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  26.77 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3067  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  29.02 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.97 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4330  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.26 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.68 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.25 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.31 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.49 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.14 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.5 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.67 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1378  aliphatic sulfonates family ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.11 
 
 
324 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355919  normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  27.59 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5002  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.56 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016963  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0694  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101106  normal  0.0226571 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.18 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21970  ABC transporter, taurine periplasmic binding protein  22.61 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.28 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1372  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  33.08 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5515  extracellular solute-binding protein family 3  24.86 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2209  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.51 
 
 
327 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.89 
 
 
330 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4824  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  22.87 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.81 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0350  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  22.31 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  26.19 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0081  ABC transport system substrate-binding protein  27.36 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3908  ABC transport system substrate-binding protein  25.63 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.074485  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  21.22 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  26.59 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3411  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.37 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0201721  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  22.84 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  22.84 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  26.91 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.66 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0113  sulfonate binding protein  24.81 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4286  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.87 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766351  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  26.83 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.59 
 
 
322 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3087  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.53 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0286269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2306  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.67 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21640  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter, substrate binding protein family 3  25.25 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  27.7 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0047  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  24.02 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0299581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.78 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0087  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.25 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191531  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.29 
 
 
338 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.29 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0114  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34.09 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.62 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0095  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34.09 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3730  ABC transport system substrate-binding protein  25.91 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.65 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0105  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34.09 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  29.14 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  30.2 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.54 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5471  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  24.03 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4416  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.64 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.343651  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2885  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  33.77 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.14 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4025  ABC transport system substrate-binding protein  25.58 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1765  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.37 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  24 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  23.89 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  22.28 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.24 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  23.89 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0419  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.66 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.402679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2479  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  31.52 
 
 
354 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  27.27 
 
 
322 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  26.47 
 
 
344 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5751  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.7 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.616352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2271  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.66 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2886  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.66 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.15 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0526  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.78 
 
 
335 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>