32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1643 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  47.43 
 
 		 177 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  37.79 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  40 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  40 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  40.74 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  38.02 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  35.15 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  33.06 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  33.93 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0408  pilus assembly protein, PilQ  36.96 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021286  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  41.67 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0406  pilus assembly protein, PilQ  31.25 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5129  type IV pilus biogenesis protein PilP  30.36 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66630  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  28.04 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  30.33 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5778  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  27.1 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45270  Pilus assembly protein  28.85 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  28.18 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0545  pilus assembly protein, PilQ  27.39 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  24.26 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  26.92 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  25.93 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  32.43 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  29.51 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  29.51 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3250  Pilus assembly protein PilP  32.38 
 
 		 181 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  29.17 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  32.26 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0829  pilus assembly protein, PilQ  26.8 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>