More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2101 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 158 aa  312  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  65.35 
 
 		 140 aa  171  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  62.41 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  66.13 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  64.06 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  64.84 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  63.78 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  59.54 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  62.12 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  61.36 
 
 		 137 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  61.36 
 
 		 137 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  58.78 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  58.02 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  58.02 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  54.07 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  58.02 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  57.72 
 
 		 143 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  54.41 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  57.72 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  56.91 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  53.28 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  56.91 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  57.72 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  52.27 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  50.76 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  47.11 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  47.11 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  47.54 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  40.32 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  46.28 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  45.53 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  45.53 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  45.53 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  44.26 
 
 		 140 aa  97.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  39.84 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 176 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  40.32 
 
 		 136 aa  91.3  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  39.57 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  37.6 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  37.6 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  39.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  38.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  38.21 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  39.02 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  39.02 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  38.21 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  38.02 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  41.32 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  33.1 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  37.19 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.07 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  38.02 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  32.23 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.52 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  36.67 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>