More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1334 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  62.41 
 
 
158 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  58.02 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  53.91 
 
 
135 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 
137 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  56.06 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  56.06 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  52.05 
 
 
168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  56.91 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  55.91 
 
 
140 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  56.1 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  49.62 
 
 
140 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  47.89 
 
 
151 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  52.76 
 
 
141 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  51.15 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 
142 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  48.82 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  50.39 
 
 
144 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  50.78 
 
 
156 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 
165 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 
149 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  48.44 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  49.22 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  48.44 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  45.65 
 
 
151 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  42.15 
 
 
142 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 
142 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  39.52 
 
 
141 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  35.66 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  38.71 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.22 
 
 
176 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  41.32 
 
 
167 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  41.32 
 
 
167 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  41.32 
 
 
167 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  34.31 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  34.31 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  34.31 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  34.31 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  34.56 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  34.59 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.15 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.19 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  32.85 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  37.7 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  35.25 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  36.69 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  35 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  37.19 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  35 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.71 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  36.8 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  27.73 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  27.73 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  31.82 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  33.88 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  34.71 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  32.58 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  34.17 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  34.17 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  35 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.23 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  30.08 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.33 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  34.17 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>