43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0007 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  94.51 
 
 		 91 bp  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03510  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.608877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  83.56 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.694922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>