More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3685 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  74.3 
 
 
181 aa  268  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  63.69 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  62.22 
 
 
181 aa  230  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  61.45 
 
 
184 aa  227  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  63.33 
 
 
181 aa  225  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  61.11 
 
 
181 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  61.11 
 
 
181 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  61.11 
 
 
181 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  60.56 
 
 
187 aa  220  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  58.89 
 
 
181 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  53.51 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.15 
 
 
216 aa  193  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  52.43 
 
 
189 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  51.35 
 
 
191 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  47.2 
 
 
217 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  50 
 
 
204 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  46.4 
 
 
225 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  47.64 
 
 
217 aa  187  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  48.89 
 
 
186 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  45.75 
 
 
217 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  51.09 
 
 
201 aa  181  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  47.57 
 
 
187 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  48.39 
 
 
186 aa  178  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  48.39 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  47.85 
 
 
192 aa  177  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  50 
 
 
184 aa  177  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  44.08 
 
 
216 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  48.37 
 
 
197 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  44.95 
 
 
219 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  48.11 
 
 
367 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  43.65 
 
 
185 aa  175  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  48.68 
 
 
192 aa  174  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  48.8 
 
 
184 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  48.65 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.25 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.25 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  41.98 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  50.33 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  40.38 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.81 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  46.52 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  46.52 
 
 
187 aa  170  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  42.79 
 
 
217 aa  170  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  48.37 
 
 
193 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  47.31 
 
 
211 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  42.45 
 
 
217 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  47.12 
 
 
200 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  47.19 
 
 
188 aa  167  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  39.81 
 
 
215 aa  167  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  40.65 
 
 
214 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  41.43 
 
 
217 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  42.25 
 
 
214 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  49.46 
 
 
194 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  46.2 
 
 
205 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  44.94 
 
 
191 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  48.39 
 
 
192 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  44.71 
 
 
209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  47.25 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  40.19 
 
 
214 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  45.55 
 
 
193 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  40.19 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  42.45 
 
 
217 aa  164  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.35 
 
 
199 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  40.09 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  44.75 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  40.09 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  44.67 
 
 
309 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  45.99 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  40.38 
 
 
215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  46.52 
 
 
199 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  39.15 
 
 
215 aa  160  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  43.27 
 
 
222 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  41.78 
 
 
217 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  40.57 
 
 
214 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  46.45 
 
 
192 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  43.96 
 
 
208 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  45.9 
 
 
193 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  41.67 
 
 
183 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  43.85 
 
 
190 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  41.35 
 
 
423 aa  158  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  44.26 
 
 
194 aa  158  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  44.26 
 
 
194 aa  158  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  38.79 
 
 
218 aa  157  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  45.74 
 
 
195 aa  157  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  37.39 
 
 
218 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  37.39 
 
 
218 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  42.33 
 
 
205 aa  157  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  37.67 
 
 
220 aa  157  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  40.67 
 
 
217 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  38.43 
 
 
216 aa  156  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  37.67 
 
 
220 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  46.11 
 
 
187 aa  156  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>