More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3313 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  64.71 
 
 		 188 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  64.71 
 
 		 188 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  64.71 
 
 		 188 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  60.59 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  55.56 
 
 		 182 aa  201  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  60.34 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  53.18 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  56.65 
 
 		 201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  53.18 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  56.82 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  55.11 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  58.38 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  53.45 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  54.6 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  51.69 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  53.41 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  49.03 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  47.46 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  49.35 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  50.65 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  50.65 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  53.29 
 
 		 198 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  48.54 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  53.9 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  49.36 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  47.74 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  47.1 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  44.25 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  49.03 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  42.08 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  42.94 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  46.45 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  50.29 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  43.5 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  38.33 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.33 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  43.32 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  49.03 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.78 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  49.68 
 
 		 440 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  46.39 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  49.36 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  46.39 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  46.54 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  43.93 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  45.81 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  50.31 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  46.39 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  43.26 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  43.45 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  44.21 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  40.8 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  43.86 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  43.86 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  43.68 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  47.78 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  48 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  45.81 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  44.51 
 
 		 200 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  44.16 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  42.2 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  43.27 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  46.1 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  42.53 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.89 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  47.1 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  44.24 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  43.1 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  44.79 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  46.45 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  43.03 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  42.2 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  43.64 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  40.8 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  42.61 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  43.64 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  42.42 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  39.78 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  44.81 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  42.2 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  42.05 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  40.59 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  43.33 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  37.16 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  42.21 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  45.51 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  40.94 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  42.21 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  43.23 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>