235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3183 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  72.35 
 
 		 553 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  78.59 
 
 		 553 aa  823    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  67.6 
 
 		 526 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  74.46 
 
 		 551 aa  782    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  77.93 
 
 		 544 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  76.97 
 
 		 567 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  76.97 
 
 		 567 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  78.76 
 
 		 519 aa  823    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 606 aa  1241    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  76.97 
 
 		 567 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  63.62 
 
 		 520 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  63.52 
 
 		 518 aa  621  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  58.11 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  63.94 
 
 		 526 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  60.87 
 
 		 552 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  64.45 
 
 		 544 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  56.65 
 
 		 488 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  52.51 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  51.69 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  51.83 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  52.14 
 
 		 482 aa  495  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  52.04 
 
 		 480 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  53 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.25 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  51.77 
 
 		 482 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  51.4 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  53 
 
 		 476 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  54.37 
 
 		 507 aa  495  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  51.82 
 
 		 472 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  52.46 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.46 
 
 		 472 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  51.37 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  53.9 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  53.22 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  50.74 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  50.32 
 
 		 498 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  51.39 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  52.92 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  50.73 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  51.15 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  51.96 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  52.26 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  54.97 
 
 		 539 aa  485  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  52.13 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  49.68 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  52.34 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  54.98 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  51.37 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  52.13 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  52.69 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  50.1 
 
 		 482 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  49.25 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  48.34 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  50.32 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  51.71 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  50.32 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  52.13 
 
 		 471 aa  482  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  53.46 
 
 		 497 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  52.93 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  50.74 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  51.23 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  52.93 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  50.96 
 
 		 477 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  52.04 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  51.91 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  50.42 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  51.69 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  52.15 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  51.26 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  51.96 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  54.27 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  50.72 
 
 		 490 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  48.37 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  51.18 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  54.27 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  52.36 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  51.7 
 
 		 476 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  51.28 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  51.7 
 
 		 476 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  54.03 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  51.39 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  50.95 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.28 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  50.85 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  50.85 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  50.11 
 
 		 494 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  51.48 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  50.64 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  51.07 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  51.28 
 
 		 469 aa  475  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  48.75 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  48.36 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  49.47 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  51.59 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  50.85 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  48.54 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  50.43 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  50.85 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  50.85 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  50.85 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>