72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2483 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 172 aa  329  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.62 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  36.36 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  39.31 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  45.61 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  45.61 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  45.61 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  31.61 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3421  FxsA  40.43 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123151  normal  0.48989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.26 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.12 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.29 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.1 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.58 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.38 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.25 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.19 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2390  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.56 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.04 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  29.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.45 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2271  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.82 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237606  normal  0.0291339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  27.21 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  27.21 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  28.48 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.31 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.45 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  28.1 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  28.29 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.93 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  31.21 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.96 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  25.15 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.68 
 
 		 196 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.46 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.15 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.32 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  30.32 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.81 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  22.73 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.49 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  27.66 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.79 
 
 		 217 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  27.66 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.36 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.29 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.97 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  28.95 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  25.58 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.36 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  23.6 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2963  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.2 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15960  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  28.17 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  34.48 
 
 		 226 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  23.6 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.87 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.88 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  28.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  28.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  28.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  28.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.1 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  27.63 
 
 		 129 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.25 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  28.87 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.13 
 
 		 195 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>