47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3421 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3421  FxsA  100 
 
 
158 aa  296  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123151  normal  0.48989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  77.84 
 
 
169 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  69.78 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  69.78 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  69.78 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  45.73 
 
 
175 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.13 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.92 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.23 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.03 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.74 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  26.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  26.79 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  28.57 
 
 
129 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  28.07 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  28.57 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  28.07 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  28.07 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  28.07 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  30.48 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.57 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
215 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  36.17 
 
 
155 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  30.38 
 
 
96 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.48 
 
 
202 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.48 
 
 
186 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.48 
 
 
202 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.48 
 
 
202 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  36.17 
 
 
155 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.48 
 
 
202 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.63 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  25.64 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.9 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.71 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.31 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.28 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.18 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.87 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 
191 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.97 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  35.51 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.11 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.19 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  27.62 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.32 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>