70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3496 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1909  hypothetical protein  41.27 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  47.14 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  47.54 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  49.18 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1072  hypothetical protein  39.06 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  49.18 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  49.18 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  49.18 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  49.18 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  45.9 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  47.54 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  42.67 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0069  hypothetical protein  41.27 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  44.26 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  44.26 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  45.9 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  44.26 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  44.26 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  44.26 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  44.26 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  42.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  41.54 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  44.26 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  48.08 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  44.12 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  43.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  43.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1297  hypothetical protein  41.82 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  41.27 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  39.34 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003286  hypothetical protein  43.4 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  40.35 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  42.62 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0917  hypothetical protein  43.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  39.34 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  36.62 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  36.84 
 
 		 81 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  40.68 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  35.94 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1969  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0541344  normal  0.0914739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  35.94 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5324  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  43.64 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  35.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  42.55 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  38.03 
 
 		 93 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>