More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3163 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  100 
 
 		 354 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  99 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  78.6 
 
 		 305 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  76.25 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  69.23 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  69.7 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  68.79 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  63.85 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  69.46 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  53.4 
 
 		 773 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  50.68 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  56.1 
 
 		 764 aa  298  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  52.41 
 
 		 771 aa  295  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  51.03 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  52.88 
 
 		 768 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  49.13 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  49.13 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  49.48 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  50.52 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  50.52 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  49.13 
 
 		 295 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  48.45 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  48.44 
 
 		 297 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  47.75 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  47.08 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  46.37 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  47.93 
 
 		 294 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  46.37 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  46.37 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  47.75 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  48.44 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  47.75 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  46.37 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  49.32 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  48.14 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  48.43 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  49.48 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  48.78 
 
 		 303 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  48.98 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  47.06 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  46.02 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  47.44 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  47.44 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 303 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  46.55 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  46.71 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  46.71 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  48.12 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  47.22 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  46.88 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  47.1 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  47.8 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  46.88 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  46.6 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 303 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  47.75 
 
 		 297 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  47.8 
 
 		 300 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  45.17 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  47.8 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 299 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  47.28 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  46.94 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  46.05 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  46.94 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  46.94 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 301 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  47.24 
 
 		 295 aa  259  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.39 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  47.4 
 
 		 295 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  46.69 
 
 		 294 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 300 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 300 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  45.64 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  46.34 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  44.75 
 
 		 303 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  44.98 
 
 		 303 aa  252  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  45.3 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>