More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2574 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  55.19 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  53.94 
 
 		 269 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.41 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 974 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  49.19 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 605 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 718 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  32.62 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 701 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 328 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.52 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 1035 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 		 326 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 326 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 347 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 983 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  27.72 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  29.52 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  37.6 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  25.22 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  39.17 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  41.05 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 1037 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.65 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.63 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.07 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.76 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 672 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  40 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  40 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  38.95 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  40 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>