More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1725 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 402 aa  808    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  68.38 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 395 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  66.16 
 
 		 397 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  67.96 
 
 		 393 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 399 aa  551  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  64.63 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  64.72 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  62.5 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.21 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  65.32 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  63.98 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  60.2 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  61.06 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  64.07 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  61.06 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  61.71 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  61.15 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.46 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  60.64 
 
 		 421 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  57.65 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  57.4 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  57.4 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  61.5 
 
 		 391 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  59.09 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  58.05 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 		 410 aa  474  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  58.59 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  57.99 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  59.71 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  59.32 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  57.46 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0675  methionine adenosyltransferase  59.95 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  57.46 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0177  S-adenosylmethionine synthetase  60.47 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.225729  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0287  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  61.38 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  56.13 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  58.27 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  60.45 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  58.31 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 		 382 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  58.25 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  57.62 
 
 		 381 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  59.08 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  58.19 
 
 		 393 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  60 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  58.84 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  57.93 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  60.72 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>